Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms