Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd1D3YXK1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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