Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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