Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Hdac5Q9Z2V6 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Hdac5Q9Z2V6 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Hdac5Q9Z2V6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Hdac5Q9Z2V6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Hdac5Q9Z2V6 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Hdac5Q9Z2V6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Hdac5Q9Z2V6 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac5Q9Z2V6 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms