Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms