Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms