Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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