Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Ccl28Q9JIL2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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Ccl28Q9JIL2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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