Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms