Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms