Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gtf3c6Q9D8P7 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gtf3c6Q9D8P7 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gtf3c6Q9D8P7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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