Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms