Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms