Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms