Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

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Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Lonrf3Q9D4H7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Lonrf3Q9D4H7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Lonrf3Q9D4H7 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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