Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stag1Q9D3E6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms