Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms