Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms