Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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