Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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