Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms