Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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RTRAFQ9CQE8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RTRAFQ9CQE8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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