Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Rnaseh2cQ9CQ18 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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