Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms