Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Hdac9Q99N13 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Hdac9Q99N13 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Hdac9Q99N13 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Hdac9Q99N13 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Hdac9Q99N13 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Hdac9Q99N13 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Hdac9Q99N13 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Hdac9Q99N13 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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