Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms