Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114 ms