Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx18Q91ZR2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms