Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Vrk3Q8K3G5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Vrk3Q8K3G5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Vrk3Q8K3G5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Vrk3Q8K3G5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Vrk3Q8K3G5 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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Vrk3Q8K3G5 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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