Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Abcf3Q8K268 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Abcf3Q8K268 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Abcf3Q8K268 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Abcf3Q8K268 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Abcf3Q8K268 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Abcf3Q8K268 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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