Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm28Q8CGC6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm28Q8CGC6 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm28Q8CGC6 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm28Q8CGC6 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm28Q8CGC6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm28Q8CGC6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm28Q8CGC6 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm28Q8CGC6 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm28Q8CGC6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm28Q8CGC6 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm28Q8CGC6 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm28Q8CGC6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm28Q8CGC6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm28Q8CGC6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm28Q8CGC6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm28Q8CGC6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm28Q8CGC6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms