Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ephb1Q8CBF3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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