Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpcpd1Q8C0L9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms