Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rbbp5Q8BX09 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rbbp5Q8BX09 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp5Q8BX09 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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