Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms