Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Nop53Q8BK35 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Nop53Q8BK35 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Nop53Q8BK35 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Nop53Q8BK35 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Nop53Q8BK35 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Nop53Q8BK35 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Nop53Q8BK35 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Nop53Q8BK35 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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