Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tspan9Q8BJU2 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms