Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Smarcal1Q8BJL0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Smarcal1Q8BJL0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Smarcal1Q8BJL0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Smarcal1Q8BJL0 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Smarcal1Q8BJL0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Smarcal1Q8BJL0 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Smarcal1Q8BJL0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Smarcal1Q8BJL0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Smarcal1Q8BJL0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Smarcal1Q8BJL0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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