Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms