Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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H2-M10.4Q85ZW8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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H2-M10.4Q85ZW8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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H2-M10.4Q85ZW8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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H2-M10.4Q85ZW8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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H2-M10.4Q85ZW8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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H2-M10.4Q85ZW8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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H2-M10.4Q85ZW8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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H2-M10.4Q85ZW8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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H2-M10.4Q85ZW8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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H2-M10.4Q85ZW8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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