Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms