Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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