Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Ttc28Q80XJ3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Ttc28Q80XJ3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Ttc28Q80XJ3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Ttc28Q80XJ3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Ttc28Q80XJ3 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Ttc28Q80XJ3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Ttc28Q80XJ3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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