Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek5Q7TSC3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nek5Q7TSC3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nek5Q7TSC3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nek5Q7TSC3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nek5Q7TSC3 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nek5Q7TSC3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Nek5Q7TSC3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek5Q7TSC3 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek5Q7TSC3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek5Q7TSC3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek5Q7TSC3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek5Q7TSC3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek5Q7TSC3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek5Q7TSC3 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek5Q7TSC3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek5Q7TSC3 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek5Q7TSC3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek5Q7TSC3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek5Q7TSC3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms