Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Shq1Q7TMX5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shq1Q7TMX5 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Shq1Q7TMX5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shq1Q7TMX5 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Shq1Q7TMX5 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shq1Q7TMX5 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Shq1Q7TMX5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shq1Q7TMX5 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.8 ms