Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf2Q6P9P0 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms