Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mvb12bQ6KAU4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms