Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Pkp4Q68FH0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Pkp4Q68FH0 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Pkp4Q68FH0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Pkp4Q68FH0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Pkp4Q68FH0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Pkp4Q68FH0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Pkp4Q68FH0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Pkp4Q68FH0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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