Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifit1Q64282 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms