Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde3bQ61409 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde3bQ61409 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms